Případná varianta viru se zadává jako rozšiřující informace k pozitivnímu výsledku testu. Pro správné reportování je nutné uvézt na jakém základě byla varianta viru stanovena. Nyní jsou aplikací a ISIN podporovány tyto možnosti:

  1. Vložení informace o variantě na základě běžném vyhodnocení PCR testu
  2. Vložení informace o varianě na základě specálního testu
    1. PCR - genotypizační test
    2. Sekvenace


1.Vložení informace při běžném vyhodnocení PCR testu

Pokud při běžném vyhodnocení PCR testu přijdete na to, že hodnoty vykazují známky některé z variant viru, je možné tento výsledek reportovat do ISIN. Běžně zpracovávaný PCR test je indikován dvěma parametry:

  1. Požadavek na vyšetření: Průkaz viru SARS-CoV-2 pomocí rRT-PCR
  2. Upřesnění metody rRT-PCR: PCR obecný test.


V případě výsledku testu: Infekce prokázaná, lze vybrat dodatkovou informaci o variantě viru v parametru PCR varianta viru. 

Pozn.: měla by být zadána pouze jedna ze suspektních možností, ty jejichž kód konřčí na S (např. VAS).

Pozn.: Možnosti VVVVVV a NELZE se neodesílají do ISIN.



2.Vložení informace při specifickém testu pro varianty

Jestliže byl po pozitivním záznamu běžného PCR testu proveden ještě další test. Je nutné pro tento test vytvořit v CovIT další záznam. V laboratoři načtěte pacienta znovu pomocí čísla žádanky ÚZIS (ne rodného čísla - múže existovat více žádanek!). Systém Vás upozorní hláškou, že žádanka již byla použita. Tuto hláčku akceptujte kliknutím na Nahrát a tím se formulář předvyplní informacemi s žádanky.

Dále postupujte podle typu testu, který jste použili:

a) Genotypizačního PCR test
b) Sekvenace

a) Genotypizační PCR test je zvolen výběrem:

  1. Požadavek na vyšetření: Průkaz viru SARS-CoV-2 pomocí rRT-PCR
  2. Upřesnění metody rRT-PCR: PCR - genotypizační test


Po té se v sekci výsledků zobrazí seznam všech PCR Kitů, které zpracovává ISIN v dané době. Po vybrání použitého PCR kitu (možno vybrat i více kitů) je nutné vyplnit i výsledek. Výslednou variantu viru vyberte v parametru PCR varianta viru

Poznámka:

  1. PCR varianta viru:
    1. musí být vyplněna
    2. pokud není v seznamu, použijte VVVVVV a do poznámky můžete uvést chybějící variantu (toto je poznámka pro laboratoř, do ISIN se neodesílá, viz níže)
    3. možnosti VVVVVV a NELZE se neodesílají do ISIN.
    4. pro ISIN je tato položka doplňková, hlavní je uvedení výsledku alespoň jednoho genotypizačního PCR testu.
  2. Parametr Výsledek testu musí být nastaven na Infekce prokázána.
  3. Pokud v seznamu není vámi používaný genotypizační PCR test, kontaktujte správce aplikace, který tento test do formuláře doplní.



b) Sekvenace - nastavte Požadavek na vyšetření na možnost Sekvenace viru SARS-CoV-2.

Výsledek testu musí být nastaven na Infekce prokázána! Pro parametr Seq. varianta viru vyberte potvrzenou variantu viru a variantu Pangolin lineage, která bude v budoucnu nastavena jako povinné pole.


Po uzavření je možné záznam vyexportovat přes tlačítko export ISIN a nahrát do ISIN pomocí dávky, jako v případě záznamů běžných výsledků testovaní reportovaných bez varianty viru covid-19.


  • No labels