Případná varianta viru se zadává jako rozšiřující informace k pozitivnímu výsledku testu. Pro správné reportování je nutné uvézt na jakém základě byla varianta viru stanovena. Nyní jsou aplikací a ISIN podporovány tyto možnosti:
- Vložení informace o variantě na základě běžném vyhodnocení PCR testu
- Vložení informace o varianě na základě specálního testu
- PCR - genotypizační test
- Sekvenace
1.Vložení informace při běžném vyhodnocení PCR testu
Pokud při běžném vyhodnocení PCR testu přijdete na to, že hodnoty vykazují známky některé z variant viru, je možné tento výsledek reportovat do ISIN. Běžně zpracovávaný PCR test je indikován dvěma parametry:
- Požadavek na vyšetření: Průkaz viru SARS-CoV-2 pomocí rRT-PCR
- Upřesnění metody rRT-PCR: PCR obecný test.
V případě výsledku testu: Infekce prokázaná, lze vybrat dodatkovou informaci o variantě viru v parametru PCR varianta viru.
Pozn.: měla by být zadána pouze jedna ze suspektních možností, ty jejichž kód konřčí na S (např. VAS).
Pozn.: Možnosti VVVVVV a NELZE se neodesílají do ISIN.
2.Vložení informace při specifickém testu pro varianty
Jestliže byl po pozitivním záznamu běžného PCR testu proveden ještě další test. Je nutné pro tento test vytvořit v CovIT další záznam. V laboratoři načtěte pacienta znovu pomocí čísla žádanky ÚZIS (ne rodného čísla - múže existovat více žádanek!). Systém Vás upozorní hláškou, že žádanka již byla použita. Tuto hláčku akceptujte kliknutím na Nahrát a tím se formulář předvyplní informacemi s žádanky.
Dále postupujte podle typu testu, který jste použili:
a) Genotypizačního PCR test
b) Sekvenace
a) Genotypizační PCR test je zvolen výběrem:
- Požadavek na vyšetření: Průkaz viru SARS-CoV-2 pomocí rRT-PCR
- Upřesnění metody rRT-PCR: PCR - genotypizační test
Po té se v sekci výsledků zobrazí seznam všech PCR Kitů, které zpracovává ISIN v dané době. Po vybrání použitého PCR kitu (možno vybrat i více kitů) je nutné vyplnit i výsledek. Výslednou variantu viru vyberte v parametru PCR varianta viru
Poznámka:
- PCR varianta viru:
- musí být vyplněna
- pokud není v seznamu, použijte VVVVVV a do poznámky můžete uvést chybějící variantu (toto je poznámka pro laboratoř, do ISIN se neodesílá, viz níže)
- možnosti VVVVVV a NELZE se neodesílají do ISIN.
- pro ISIN je tato položka doplňková, hlavní je uvedení výsledku alespoň jednoho genotypizačního PCR testu.
- Parametr Výsledek testu musí být nastaven na Infekce prokázána.
- Pokud v seznamu není vámi používaný genotypizační PCR test, kontaktujte správce aplikace, který tento test do formuláře doplní.
b) Sekvenace - nastavte Požadavek na vyšetření na možnost Sekvenace viru SARS-CoV-2.
Výsledek testu musí být nastaven na Infekce prokázána! Pro parametr Seq. varianta viru vyberte potvrzenou variantu viru a variantu Pangolin lineage, která bude v budoucnu nastavena jako povinné pole.
Po uzavření je možné záznam vyexportovat přes tlačítko export ISIN a nahrát do ISIN pomocí dávky, jako v případě záznamů běžných výsledků testovaní reportovaných bez varianty viru covid-19.